Il terzo livello, la volta, eleva lo sguardo verso la gloria celeste. Ispirato all'Apocalisse di San Giovanni, Palomino rappresentò la Gerusalemme Celeste, con Dio Padre al centro, circondato da cori di angeli e santi, presieduta da San Vicente Ferrer, l’“angelo dell’Apocalisse”. All'estremità opposta, l'arcangelo San Michele combatte contro il drago infernale, mentre luce e colore avvolgono il visitatore in una visione di trascendenza.
L'insieme culminava nell'abside, oggi scomparso, dove erano rappresentati lo Spirito Santo, l'Agnello Mistico e i due patroni del tempio, completando il messaggio della Trinità e della Redenzione.